Ortopedija obuhvata i posebne discipline kao što su sportska ortopedija i ortopedska onkologija od kojih svaka ima posebnu svrhu u liječenju bolesti mišićno koštanog sistema. Sportska ortopedija usmjerena je na liječenje povreda i povezanih stanja nastalih tjelesnim aktivnostima. Specijalisti ortopedije dijagnosticiraju i liječe brojne probleme uzrokovane sportskim povredama. Takve povrede mogu biti različite - od manjih uganuća do složenih prijeloma i povreda ili pucanja ligamenata. Za popravak oštećenih zglobova, tetiva i ligamenata koriste se tehnike poput artroskopske kirurgije. Cilj liječenja je pomoći sportistima i aktivnim pojedincima da se vrate na nivo vrhunskih performansi i da se u isto vrijeme spriječe buduće povrede. Taj se cilj može postići prilagođenim programima rehabilitacije i strategijama za prevenciju povreda. Ortopedska onkologija bavi se dijagnosticiranjem i liječenjem tumora koji zahvaćaju mišićno koštani sistem. Ti tumori mogu biti benigni ili maligni i nastaju unutar kostiju, mekih tkiva ili hrskavice. Specijalisti ortopedske onkologije primjenjuju multidisciplinarni pristup u rješavanju ovakvih stanja. Rješenja mogu uključiti kirurško uklanjanje tumora, rekonstrukciju zahvaćenih područja, hemoterapije i terapije zračenjem te praćenje eventualnog ponovnog pojavljivanja bolesti. Cilj je osigurati sveobuhvatnu njegu kojom se garantiraju najbolji rezultati uz očuvanje funkcionalnosti i pokretljivosti.