Bakterijske bolesti dišnog sustava mogu se javiti u gornjim ili donjim regijama respiratornog trakta. Gornja regija sastoji se od nosa, ždrijela i drugih struktura kao što su srednje uho i sinusi, dok donji dio sustava sastoji se od dušnika, dušnica i malih dijelova dišnih puteva poput bronhiola i alveola. Respiratorne infekcije kod ljudi su vrlo česta pojava i mogu se javiti čak 6-10 puta godišnje. Najbitnija razlika između bakterijske i virusne infekcije je djelotvornost antibiotika. Dok je kod bakterijskih infekcija antibiotik lijek izbora, kod virusnih infekcija terapija se većinom svodi na potpornu terapiju odmorom, nadoknadom tekućine i vitaminom C. Sekundarne bakterijske infekcije mogu se javiti kod pojedinaca koji su nedavno preboljeli neku virusnu bolest, što je dovelo do pada imuniteta i otvorilo mogućnost za bakterijsku infekciju. Bakterijske infekcije često imaju intenzivniji tijek i simptome, a oporavak je puno brži uz antibiotike. Slijedi popis i opis bakterijskih bolesti dišnog sustava, kao što su faringitis, streptokokni faringitis, upala srednjeg uha i epiglotitis.